Podle ministra financí je problém v krajích a jednotlivých ministerstvech, pod kterými fungovali kontroloři. "Kontrolují auditoři s přenesenou působností a ti nejsou podřízeni ministrovi financí, ale správcům těch programů - krajům, jednotlivým ministerstvům," řekl Kalousek. Nově by měl vzniknout pod ministerstvem financí zcentralizovaný dozor, který bude auditovat všech 24 operačních programů.

"Nechci, aby to vypadalo, že by se Komise domnívala, že Kalousek je jeden svatý spravedlivý. Jde i o to, že ministr financí je jeden z mála členů vlády, který nespravuje žádný operační program. Pod ním proto bude audit nezávislejší," řekl ministr a dodal: "Dosud se ministerstvo financí, když certifikovalo, muselo opírat jen o informace správců programů a jejich auditorů."

Novým dozorem by tak měly být naplněny požadavky Evropské komise, která vyžaduje odstranění roztříštěnosti v řízení operačních programů a zcentralizování auditu. Poté by měly být dotace z Evropské unie znovu vypláceny. "Až uděláme systémové změny, doufám, že od září nám faktury proplácet budou," myslí si ministr.

Problém Kalousek spatřuje také v roztříštěnosti na 24 operačních programů. "Zemi naší velikosti by slušelo maximálně pět programů a sedm priorit," myslí si Kalousek s tím, že takto by situaci rád viděl v příštím finančním období Evropské unie.

Kalousek se rovněž hypoteticky vyjádřil k tomu, co by nastalo při dalších případných otřesech eurozóny: "Z ohrožení finančního a bankovního sektoru v České republice nemám žádné obavy. Jiná věc je, že další otřesy v eurozóně by zprostředkovaně dopadly i na českou ekonomiku." Další přitvrzení v oblasti financí však Kalousek nepodporuje.